I simulated a dataset with missing not at random. And then I used mice()to impute it, but R does not return a complete dataset for me.
My code looks like:
tempData <- mice(data1)
completedData <- complete(tempData)
data1 is the dataset with missing. tempData is the mids object (this step is successful). But when I use complete(), R returns an error message:
"Error in if (length(unique(colnames(data))) != ncol(data)) stop("items must have unique names in data input", : argument is of length zero"
Why this happens?
I have attached the dataset to replicate the error and provide the code to do this below:
data1<-read.delim("path where the file is stored",sep="\t")
tempData <- mice(data1)
completedData <- complete(tempData)
dataset:
"V1" "V2" "V3" "V4" "V5" "V6" "V7" "V8" "V9" "V10"
"1" 1 NA 0 0 0 1 NA 0 NA NA
"2" 0 0 NA 0 0 1 0 0 0 NA
"3" 0 1 NA NA NA NA 1 1 NA 1
"4" 0 1 0 1 NA 1 NA 1 0 NA
"5" NA NA 0 1 1 NA 0 0 0 NA
"6" NA NA 1 0 NA 1 0 1 1 NA
"7" 0 1 NA NA NA 1 NA 0 0 NA
"8" 0 1 NA 0 0 NA 1 NA 0 1
"9" 0 1 0 0 0 NA 0 NA 0 1
"10" NA NA NA 0 NA 1 0 NA 0 0
"11" 0 1 NA 0 0 NA NA NA 1 0
"12" 0 0 NA 0 NA NA 0 1 NA 1
"13" 0 NA NA NA NA NA 0 1 0 NA
"14" 0 1 0 NA NA 0 NA NA 0 0
"15" 1 1 NA NA 0 0 0 1 0 0
"16" 1 1 NA 0 NA 0 NA 0 NA NA
"17" NA 0 NA NA NA 0 NA NA NA NA
"18" NA NA NA NA NA NA 1 0 0 1
"19" NA 0 NA 0 NA 1 NA NA NA 0
"20" 0 NA NA NA NA 0 NA NA 1 NA
"21" 0 NA 0 0 NA NA NA 0 0 NA
"22" 0 1 0 0 0 NA NA 0 NA 0
"23" 1 1 NA 0 NA 0 1 1 0 1
"24" NA NA 1 NA 0 NA NA 1 0 1
"25" 0 0 0 NA NA NA 0 NA NA NA
"26" 0 1 NA NA 0 NA NA NA 0 1
"27" 0 NA NA NA 0 0 1 0 0 0
"28" NA NA NA NA 0 0 NA NA 1 1
"29" NA 0 0 NA 1 0 0 NA NA 0
"30" NA 0 0 NA 0 0 NA NA NA 1
"31" NA 1 0 NA NA NA NA NA 0 0
"32" 0 0 NA 0 0 0 NA 1 NA NA
"33" NA 1 1 0 0 0 0 NA 0 NA
"34" NA 1 0 0 NA 0 0 NA 1 0
"35" NA 1 0 0 NA 0 0 1 0 NA
"36" NA 1 1 NA 0 0 1 0 0 NA
"37" NA NA 1 NA NA 0 NA NA NA 0
"38" NA 1 0 NA NA 0 NA NA 0 1
"39" 0 1 NA 0 NA NA 1 1 0 NA
"40" 0 NA NA 0 0 NA NA 0 0 0
"41" 0 1 NA 0 0 NA 0 NA NA 0
"42" NA NA NA NA NA NA NA 1 0 0
"43" NA 1 1 0 0 NA 0 1 NA 0
"44" NA 0 NA 0 NA 0 NA 1 NA NA
"45" 0 0 0 NA 0 NA 0 NA 0 NA
"46" NA 1 0 0 NA NA 0 1 NA 0
"47" 0 1 1 0 0 1 0 1 0 0
"48" 1 1 NA 1 0 1 NA 0 NA 0
"49" NA NA NA 0 0 NA 0 NA NA NA
"50" 1 1 1 NA NA NA NA NA 0 NA
Thanks!
