How does R handle filtering data frames

Question

Relatively new user to R and still trying to get my bearings on how R handles dataframes.

Specifically, I am trying to filter a data frame based on a column value.

The Python pandas equivalent would be:

df_temp = df.loc[df['col1']==1,'col1']

From my experience, this returns a Series where all values equal 1.

I'm trying to do something similar in R where I have a dataframe, I'm using the code below, however, I keep getting the full-length column returned with values of 1 and "NA"

temp <- RAVE_ITN_BVAS_ADVIS3[RAVE_ITN_BVAS_ADVIS3$`Sensorineural deafness`==1, 'Sensorineural deafness']

So my question is two-fold:

Is there a better way to filter data frames in R?
Does R simply turn all values that do not equal 1 into NA and then return the full-length column? If so, this would be frustrating as then it brings up issues with deal with NAs all the time.

Any input appreciates and let me know how I can further clarify.

Thank you all!

Thanks @Parfait, this led me to use: temp <- RAVE_ITN_BVAS_ADVIS3[which(RAVE_ITN_BVAS_ADVIS3$`Sensorineural deafness`==1), 'Sensorineural deafness'] This returns a vector as I expect of just 1s — wingsoficarus116, Jan 21 '19 at 20:21

score 0 · Answer 1 · answered Jan 21 '19 at 19:27

0

You can use the package dplyr and use the function filter:

filter(RAVE_ITN_BVAS_ADVIS3, `Sensorineural deafness`==1)

Also, I recommend you to use the package data.table:

RAVE_ITN_BVAS_ADVIS3[`Sensorineural deafness`==1]

Best

answered Jan 21 '19 at 19:27

LocoGris

4,432
3
15
30

score 0 · Answer 2 · answered Jan 21 '19 at 20:27

Thanks all for the input, I ended up finding I believe a similar issue here (thanks to Parfait's comment)

Subsetting R data frame results in mysterious NA rows

I ended up using:

temp <- RAVE_ITN_BVAS_ADVIS3[which(RAVE_ITN_BVAS_ADVIS3$`Sensorineural deafness`==1),
                             'Sensorineural deafness']

which returns:

 [1] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1

The prior code without the use of which provided:

temp <- RAVE_ITN_BVAS_ADVIS3[RAVE_ITN_BVAS_ADVIS3$`Sensorineural deafness`==1,
                            'Sensorineural deafness']


   [1]  1  1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
  [42] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA  1 NA
  [83] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [124] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [165] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [206] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [247] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [288] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [329] NA NA NA NA NA NA  1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [370] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [411] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [452] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [493] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [534] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA  1  1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [575] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [616] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [657] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [698] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [739] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [780] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [821] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [862] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [903] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [944] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA  1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA  1  1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA  1 NA NA NA NA NA
 [985] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
 [ reached getOption("max.print") -- omitted 2499 entries ]

How does R handle filtering data frames

2 Answers2