I wish to separate my habitat data into two different columns, one by the column headers and the other by their respective values.
I have tried using pivot_longer
, however it returns me an error, here is how I tried to do it:
pivot_longer(cols= habitat[, 6:57], names_to="habitat_type", habitat)
what it should look like:
month year LOC_ID GBW_NUM OBS_DT habitat_type habitat_code
1 8 2003 LOC569491 76550 2003-08-06 GARDEN_SIZE A
2 11 2003 LOC575706 76863 2003-11-06 GARDEN_SIZE B
3 10 2008 LOC575706 76863 2008-10-09 GARDEN_SIZE A
4 11 2003 LOC575712 76869 2003-11-06 LARGE_DECID_TREES C
5 8 2008 LOC575712 76869 2008-08-08 SMALL_CONIF_TREES A
6 11 2003 LOC591752 76998 2003-11-06 LARGE_CONIF_TREES B
Reproducible code:
structure(list(month = c(8, 11, 10, 11, 8, 11, 3, 4, 3, 1, 10,
12, 6, 6, 12, 10, 10, 11, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,
1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 12, 2, 3, 2, 1, 3, 9, 9, 9, 4, 1, 3),
year = c(2003, 2003, 2008, 2003, 2008, 2003, 2005, 2005,
2020, 2008, 2010, 2013, 2012, 2018, 2012, 2016, 2017, 2003,
1995, 1995, 1995, 2003, 1995, 1995, 1995, 1995, 1995, 1995,
1995, 1995, 1995, 1995, 1995, 1995, 1995, 1995, 2016, 2017,
2002, 2003, 2003, 2003, 1995, 2007, 2007, 2008, 2018, 2017,
2017, 2017), LOC_ID = c("LOC569491", "LOC575706", "LOC575706",
"LOC575712", "LOC575712", "LOC591752", "LOC610239", "LOC614296",
"LOC674315", "LOC675786", "LOC794326", "LOC794326", "LOC973627",
"LOC973627", "LOC1354719486425", "LOC1314108", "LOC2174194",
"LOC1300619774", "LOC1300613011", "LOC1300612920", "LOC1300615617",
"LOC1300609972", "LOC1300611058", "LOC1300612277", "LOC1300605354",
"LOC1300604907", "LOC1300604931", "LOC1300605204", "LOC1300604590",
"LOC1300604590", "LOC1300606661", "LOC1300602119", "LOC1300602170",
"LOC1300602081", "LOC1300622040", "LOC1300622040", "LOC1300622040",
"LOC1300622040", "LOC1038934429015", "LOC1038934429015",
"LOC287351", "LOC287518", "LOC1300624005", "LOC661928", "LOC661928",
"LOC661928", "LOC661928", "LOC2009340", "LOC1990233", "LOC1489432713333"
), GBW_NUM = c("76550", "76863", "76863", "76869", "76869",
"76998", "79154", "79846", "85416", "85665", "89078", "89078",
"90835", "90835", "97926", "93406", "26517", "72370", "65158",
"65056", "68017", "61805", "63019", "64369", "54273", "53090",
"53147", "53901", "52289", "52289", "56811", "03152", "03274",
"03043", "56063", "56063", "56063", "56063", "94001", "94001",
"75537", "75669", "67577", "84253", "84253", "84253", "84253",
"25834", "25782", "99058"), OBS_DT = structure(c(12270, 12362,
14161, 12362, 14099, 12362, 12856, 12903, 18352, 13890, 14889,
16040, 15502, 17693, 15679, 17100, 17443, 12362, 9131, 9131,
9131, 12078, 9131, 9131, 9131, 9131, 9131, 9131, 9131, 9132,
9131, 9131, 9131, 9131, 9131, 9132, 16808, 17193, 12024,
12084, 12123, 12106, 9131, 13579, 13760, 14123, 17780, 17264,
17188, 17230), class = "Date"), GARDEN_SIZE = c("M", "S",
"S", "M", "S", "M", "L", "S", "M", "S", "M", "M", "L", "L",
"S", "M", "M", "M", "M", "S", "M", "L", "M", "L", "L", "L",
"L", "L", "L", "L", "M", "M", "L", "L", "S", "M", "S", "S",
"S", "S", "L", "M", "L", "M", "M", "M", "S", "L", "S", "S"
), GARDEN_AGE = c("A", "B", "C", "D", "D", "D", "B", "C",
"D", "C", "D", "C", "E", "E", "B", "B", "D", "A", "E", "B",
"D", "D", "D", "E", "E", "D", "D", "E", "D", "E", "E", "D",
"E", "C", "E", "C", "D", "D", "E", "E", "E", "E", "E", "B",
"B", "B", "C", "E", "E", "E"), SMALL_DECID_TREES = c("B",
"B", "A", "C", "C", "C", "E", "D", "D", "B", "E", "E", "D",
"D", "B", "C", "D", "D", "A", "C", "C", "D", NA, "E", "E",
"E", "E", "D", "D", "D", "C", "D", "E", "D", "A", "C", "C",
"C", "B", "C", "E", "D", "E", "C", "C", "C", "C", "E", "C",
"E"), LARGE_DECID_TREES = c(NA, "C", "B", "B", "B", "B",
NA, "A", "A", "A", "C", "C", "A", "A", "A", "D", "A", "A",
"C", NA, "A", "A", "C", "D", "E", "C", "E", "C", "C", "A",
"C", NA, "E", "D", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "D", "C",
"D", "B", "C", "C", "B", "D", "A", "A"), SMALL_CONIF_TREES = c(NA,
"A", "A", "A", "A", "B", NA, "E", "C", "A", "A", "C", "A",
"A", "A", "C", "A", "A", "C", "C", "A", "B", "C", "C", "E",
"B", "C", "E", "E", "D", NA, "E", "D", "E", "A", "D", "C",
"A", "B", "B", "A", "C", "E", "A", "A", "A", "A", "E", "B",
"A"), LARGE_CONIF_TREES = c(NA, "A", "A", "A", "A", NA, NA,
"A", "A", "A", "A", "B", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A",
NA, "A", "A", NA, "E", "D", "D", "D", "C", "D", "A", NA,
NA, "E", "E", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "C", "C", "D",
"A", "A", "A", "A", "E", "B", "A"), LAWN = c("C", "C", "D",
"D", "B", "D", "B", "C", "C", "D", "C", "C", "D", "D", "D",
"D", "D", "E", "B", "B", "C", "B", "D", "C", "B", "C", "C",
"C", "C", "C", "E", "C", "B", "D", "E", "C", "C", "C", "E",
"E", "D", "C", "B", "E", "E", "D", "C", "B", "B", "B"), FLOWERBEDS = c("B",
"B", "B", "B", "B", "B", "B", "C", "D", "B", "B", "B", "B",
"B", "B", "B", "B", "B", "C", "B", "B", "B", "B", "B", "B",
"B", "A", "B", "C", "B", "B", "C", "B", "B", "B", "B", "B",
"B", "B", "B", "B", "B", "B", "B", "B", "B", "B", "B", "B",
"C"), SHRUBBERIES = c("B", "A", "B", "B", "A", "B", "B",
"A", "A", "A", "C", "C", "B", "B", "B", "B", "B", "A", "A",
"B", "B", "B", "C", "B", "B", "B", "B", "B", "B", "B", "B",
"B", "C", "B", "A", "B", "B", "B", "B", "B", "B", "B", "B",
"B", "B", "B", "B", "C", "B", "B"), VEGETABLES = c("A", "A",
"A", "A", "A", "B", "A", "A", "A", "A", "B", "B", "A", "A",
"A", "A", "B", "A", "A", "A", "A", "B", "A", "B", "A", "A",
"B", "B", "B", "B", "A", "A", "B", "A", "A", "B", "B", "B",
"A", "A", "B", "B", "B", "A", "B", "C", "C", "B", "A", "B"
), WILD = c("A", "A", "B", "A", "C", "A", "C", "B", "A",
"A", "A", "B", "A", "A", "A", "B", "B", "A", "B", "A", "A",
"A", "A", "A", "B", "B", "C", NA, "A", "B", "A", "A", "B",
"B", "A", "A", "A", "A", "B", "B", NA, "B", "C", "A", "A",
"A", "B", "B", "B", "B"), BARREN = c("A", "B", "A", "B",
"B", "B", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A",
"A", "A", "A", "B", "B", "A", "A", "B", "B", "C", "B", NA,
"B", "B", "A", "B", "A", "A", "A", "B", "B", "A", "A", "A",
"B", "B", "A", "A", "A", "A", "B", "A", "A", "A"), ORCHARD = c("A",
"A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "B", "B", "A",
"A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "B",
"A", "A", NA, "A", "A", "A", "A", "A", "B", "A", "A", "A",
"A", "A", "A", NA, "A", NA, "A", "A", "A", "A", "B", "A",
"A"), FENCE = c("D", "B", "C", "D", "C", "C", "E", "C", "D",
"B", "B", "B", "C", "C", "C", "D", "E", "D", "B", "B", "C",
"B", "A", "A", "A", "B", "C", NA, "B", "B", "D", "D", "A",
"B", "B", "E", "D", "E", "D", "D", NA, "B", "B", "E", "D",
"D", "C", "B", "B", "D"), WALL = c("B", "A", "A", NA, "A",
"A", NA, "A", "B", "A", "A", "A", "C", "C", "A", "C", "A",
"A", "A", "A", "B", "B", "D", "A", "A", "A", "A", "E", "A",
"B", "B", "A", "A", "B", "A", "A", "A", "A", "B", "B", NA,
"C", "A", "B", "B", "B", "B", "B", "B", "A"), BUILDINGS = c("B",
"B", "C", NA, "A", "B", NA, "A", "B", "A", "B", "A", "B",
"B", "C", "B", "A", "B", "C", "B", "B", "B", "D", "A", "A",
"B", "B", "B", "A", "B", NA, "B", "A", "B", "B", "B", "B",
"B", "B", "B", NA, "B", "B", "B", "B", "B", "B", "C", "B",
"B"), LOW_EVERGR_HEDGE = c("A", "B", "A", NA, "A", "B", NA,
"B", "B", "A", "C", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A",
"A", "A", "A", "A", "B", "A", "B", "A", NA, "B", "A", "A",
"B", "B", NA, "B", "A", "A", "A", "A", "A", "B", "B", "A",
"A", "A", "A", "A", "B", "B", "B"), HIGH_EVERGR_HEDGE = c("A",
"A", "A", NA, "A", "A", NA, "A", "A", "A", "A", "B", "A",
"A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "C", "A",
"A", "A", NA, "B", "B", "A", "B", NA, "C", "B", "A", "A",
"A", "A", "A", "B", "A", "B", "A", "A", "A", "B", "A", "A",
"A"), LOW_DECID_HEDGE = c("A", "A", "B", NA, "B", "A", NA,
"A", "A", "B", "C", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A",
"A", "A", "C", "A", "B", "A", "C", "B", NA, "B", "A", "B",
"A", NA, "B", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "C", "A", "B",
"A", "A", "A", "A", "D", "B", "A"), HIGH_DECID_HEDGE = c("A",
"A", "A", NA, "A", "A", "E", "A", "A", "A", "B", "C", "A",
"A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "A", "B", "A",
"B", "C", NA, "B", "B", "A", "A", "D", "B", "A", "A", "A",
"A", "A", "A", "C", "A", "B", "A", "A", "A", "A", "A", "A",
"A")), row.names = c(NA, 50L), class = "data.frame")